Protein–RNA interactions for Protein: Q60829

Ppp1r1b, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r1bQ60829 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ppp1r1bQ60829 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms