Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Traf3Q60803 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.9 ms