Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Stxbp3Q60770 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms