Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Atf3Q60765 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms