Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm1Q60636 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms