Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sin3aQ60520 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms