Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Bbs12Q5SUD9 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms