Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Trim58Q5NCC9 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Trim58Q5NCC9 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim58Q5NCC9 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim58Q5NCC9 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Trim58Q5NCC9 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Trim58Q5NCC9 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trim58Q5NCC9 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trim58Q5NCC9 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
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Trim58Q5NCC9 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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