Protein–RNA interactions for Protein: Q58FA4

E2f8, Transcription factor E2F8, mousemouse

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Length 860 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f8Q58FA4 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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E2f8Q58FA4 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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E2f8Q58FA4 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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E2f8Q58FA4 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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E2f8Q58FA4 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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E2f8Q58FA4 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
E2f8Q58FA4 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms