Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

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Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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