Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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Kdm5aQ3UXZ9 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
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Kdm5aQ3UXZ9 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kdm5aQ3UXZ9 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
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Kdm5aQ3UXZ9 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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Kdm5aQ3UXZ9 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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Kdm5aQ3UXZ9 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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Kdm5aQ3UXZ9 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Kdm5aQ3UXZ9 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Kdm5aQ3UXZ9 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Kdm5aQ3UXZ9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
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Kdm5aQ3UXZ9 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Kdm5aQ3UXZ9 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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Kdm5aQ3UXZ9 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kdm5aQ3UXZ9 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kdm5aQ3UXZ9 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kdm5aQ3UXZ9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kdm5aQ3UXZ9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kdm5aQ3UXZ9 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kdm5aQ3UXZ9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kdm5aQ3UXZ9 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kdm5aQ3UXZ9 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kdm5aQ3UXZ9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kdm5aQ3UXZ9 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Kdm5aQ3UXZ9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kdm5aQ3UXZ9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kdm5aQ3UXZ9 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kdm5aQ3UXZ9 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kdm5aQ3UXZ9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kdm5aQ3UXZ9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kdm5aQ3UXZ9 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kdm5aQ3UXZ9 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Kdm5aQ3UXZ9 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kdm5aQ3UXZ9 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kdm5aQ3UXZ9 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kdm5aQ3UXZ9 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kdm5aQ3UXZ9 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kdm5aQ3UXZ9 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Kdm5aQ3UXZ9 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms