Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Pfdn4Q3UWL8 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Pfdn4Q3UWL8 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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Pfdn4Q3UWL8 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Pfdn4Q3UWL8 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Pfdn4Q3UWL8 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pfdn4Q3UWL8 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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