Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capn13Q3UW68 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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