Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sf3b2Q3UJB0 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sf3b2Q3UJB0 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms