Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2P1

Sec24a, Protein transport protein Sec24A, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec24aQ3U2P1 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec24aQ3U2P1 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec24aQ3U2P1 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec24aQ3U2P1 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec24aQ3U2P1 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec24aQ3U2P1 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec24aQ3U2P1 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sec24aQ3U2P1 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sec24aQ3U2P1 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sec24aQ3U2P1 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sec24aQ3U2P1 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sec24aQ3U2P1 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sec24aQ3U2P1 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sec24aQ3U2P1 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sec24aQ3U2P1 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sec24aQ3U2P1 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sec24aQ3U2P1 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sec24aQ3U2P1 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sec24aQ3U2P1 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sec24aQ3U2P1 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sec24aQ3U2P1 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms