Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V1

Khsrp, Far upstream element-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KhsrpQ3U0V1 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KhsrpQ3U0V1 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms