Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWN3

Cnnm2, Metal transporter CNNM2, mousemouse

Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm2Q3TWN3 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnnm2Q3TWN3 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnnm2Q3TWN3 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnnm2Q3TWN3 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnnm2Q3TWN3 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnnm2Q3TWN3 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnnm2Q3TWN3 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnnm2Q3TWN3 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnnm2Q3TWN3 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnnm2Q3TWN3 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnnm2Q3TWN3 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnnm2Q3TWN3 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnnm2Q3TWN3 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnnm2Q3TWN3 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnnm2Q3TWN3 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnnm2Q3TWN3 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnnm2Q3TWN3 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnnm2Q3TWN3 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnnm2Q3TWN3 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnnm2Q3TWN3 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnnm2Q3TWN3 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnnm2Q3TWN3 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnnm2Q3TWN3 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnnm2Q3TWN3 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnnm2Q3TWN3 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnnm2Q3TWN3 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnnm2Q3TWN3 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnnm2Q3TWN3 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnnm2Q3TWN3 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnnm2Q3TWN3 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnnm2Q3TWN3 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnnm2Q3TWN3 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnnm2Q3TWN3 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnnm2Q3TWN3 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnnm2Q3TWN3 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnnm2Q3TWN3 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnnm2Q3TWN3 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnnm2Q3TWN3 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnnm2Q3TWN3 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnnm2Q3TWN3 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnnm2Q3TWN3 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnnm2Q3TWN3 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnnm2Q3TWN3 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnnm2Q3TWN3 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnnm2Q3TWN3 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnnm2Q3TWN3 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnnm2Q3TWN3 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnnm2Q3TWN3 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnnm2Q3TWN3 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnnm2Q3TWN3 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnnm2Q3TWN3 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnnm2Q3TWN3 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cnnm2Q3TWN3 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnnm2Q3TWN3 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnnm2Q3TWN3 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnnm2Q3TWN3 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnnm2Q3TWN3 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnnm2Q3TWN3 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnnm2Q3TWN3 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnnm2Q3TWN3 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnnm2Q3TWN3 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnnm2Q3TWN3 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnnm2Q3TWN3 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnnm2Q3TWN3 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnnm2Q3TWN3 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnnm2Q3TWN3 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnnm2Q3TWN3 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnnm2Q3TWN3 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cnnm2Q3TWN3 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnnm2Q3TWN3 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms