Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ccndbp1Q3TVC7 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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