Protein–RNA interactions for Protein: Q3TRM4

Pnpla6, Neuropathy target esterase, mousemouse

Predictions only

Length 1,355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnpla6Q3TRM4 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pnpla6Q3TRM4 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms