Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Usp39Q3TIX9 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Usp39Q3TIX9 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Usp39Q3TIX9 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Usp39Q3TIX9 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Usp39Q3TIX9 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Usp39Q3TIX9 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Usp39Q3TIX9 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp39Q3TIX9 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms