Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RubcnlQ3TD16 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms