Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXB8

Colec11, Collectin-11, mousemouse

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec11Q3SXB8 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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Colec11Q3SXB8 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Colec11Q3SXB8 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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