Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Fam178bQ24JP3 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Fam178bQ24JP3 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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