Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms