Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC14□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC14□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trim71Q1PSW8 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
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