Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spatc1Q148B6 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spatc1Q148B6 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spatc1Q148B6 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spatc1Q148B6 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Spatc1Q148B6 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spatc1Q148B6 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spatc1Q148B6 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spatc1Q148B6 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spatc1Q148B6 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spatc1Q148B6 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spatc1Q148B6 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spatc1Q148B6 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spatc1Q148B6 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spatc1Q148B6 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spatc1Q148B6 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Spatc1Q148B6 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Spatc1Q148B6 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spatc1Q148B6 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spatc1Q148B6 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spatc1Q148B6 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spatc1Q148B6 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spatc1Q148B6 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spatc1Q148B6 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spatc1Q148B6 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spatc1Q148B6 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spatc1Q148B6 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spatc1Q148B6 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spatc1Q148B6 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spatc1Q148B6 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spatc1Q148B6 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spatc1Q148B6 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Spatc1Q148B6 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Spatc1Q148B6 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Spatc1Q148B6 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Spatc1Q148B6 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Spatc1Q148B6 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Spatc1Q148B6 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Spatc1Q148B6 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Spatc1Q148B6 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Spatc1Q148B6 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
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Spatc1Q148B6 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Spatc1Q148B6 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
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Spatc1Q148B6 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Spatc1Q148B6 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Spatc1Q148B6 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
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Spatc1Q148B6 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
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Spatc1Q148B6 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Spatc1Q148B6 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Spatc1Q148B6 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Spatc1Q148B6 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
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Spatc1Q148B6 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Spatc1Q148B6 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Spatc1Q148B6 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Spatc1Q148B6 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
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Spatc1Q148B6 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Spatc1Q148B6 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms