Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rundc1Q0VDN7 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms