Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cntn3Q07409 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Cntn3Q07409 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cntn3Q07409 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Cntn3Q07409 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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Cntn3Q07409 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Cntn3Q07409 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Cntn3Q07409 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Cntn3Q07409 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Cntn3Q07409 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Cntn3Q07409 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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