Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 AC164597.2-201ENSMUST00000226738 603 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 AC116724.1-201ENSMUST00000227900 972 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Olfr479-201ENSMUST00000063151 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Olfr816-201ENSMUST00000071605 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Gm7289-201ENSMUST00000168993 734 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Vmn2r-ps76-201ENSMUST00000173876 739 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Vmn1r-ps17-201ENSMUST00000175797 894 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Gm19269-201ENSMUST00000211401 804 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Gm17611-202ENSMUST00000220613 814 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 5033424D13Rik-201ENSMUST00000221779 648 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 CT030185.2-201ENSMUST00000222614 1310 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Siah2Q06986 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms