Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Apoc2Q05020 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms