Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gja5Q01231 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms