Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Grin2bQ01097 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Grin2bQ01097 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Grin2bQ01097 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Grin2bQ01097 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Grin2bQ01097 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Grin2bQ01097 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Grin2bQ01097 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Grin2bQ01097 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Grin2bQ01097 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Grin2bQ01097 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Grin2bQ01097 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Grin2bQ01097 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Grin2bQ01097 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Grin2bQ01097 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Grin2bQ01097 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Grin2bQ01097 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Grin2bQ01097 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Grin2bQ01097 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Grin2bQ01097 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Grin2bQ01097 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Grin2bQ01097 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Grin2bQ01097 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Grin2bQ01097 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Grin2bQ01097 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Grin2bQ01097 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Grin2bQ01097 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Grin2bQ01097 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Grin2bQ01097 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Grin2bQ01097 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Grin2bQ01097 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Grin2bQ01097 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Grin2bQ01097 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms