Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb2Q00977 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gjb2Q00977 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms