Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itga4Q00651 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itga4Q00651 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms