Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bop1P97452 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bop1P97452 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bop1P97452 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Bop1P97452 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bop1P97452 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Bop1P97452 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Bop1P97452 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Bop1P97452 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Bop1P97452 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Bop1P97452 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Bop1P97452 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms