Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Irx1P81068 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Irx1P81068 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Irx1P81068 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Irx1P81068 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Irx1P81068 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
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Irx1P81068 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Irx1P81068 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Irx1P81068 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Irx1P81068 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Irx1P81068 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Irx1P81068 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Irx1P81068 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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