Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tp53bp1P70399 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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