Protein–RNA interactions for Protein: P70289

Ptprv, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase V, mousemouse

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Length 1,705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprvP70289 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
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PtprvP70289 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprvP70289 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprvP70289 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprvP70289 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprvP70289 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprvP70289 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprvP70289 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
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PtprvP70289 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprvP70289 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprvP70289 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprvP70289 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprvP70289 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprvP70289 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
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PtprvP70289 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
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PtprvP70289 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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PtprvP70289 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprvP70289 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
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PtprvP70289 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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PtprvP70289 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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PtprvP70289 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprvP70289 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprvP70289 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprvP70289 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprvP70289 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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PtprvP70289 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprvP70289 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprvP70289 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprvP70289 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprvP70289 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprvP70289 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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PtprvP70289 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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PtprvP70289 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprvP70289 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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PtprvP70289 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprvP70289 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprvP70289 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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PtprvP70289 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprvP70289 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprvP70289 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprvP70289 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprvP70289 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprvP70289 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprvP70289 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprvP70289 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprvP70289 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprvP70289 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprvP70289 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprvP70289 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprvP70289 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprvP70289 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprvP70289 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprvP70289 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprvP70289 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprvP70289 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprvP70289 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprvP70289 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprvP70289 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprvP70289 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms