Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chl1P70232 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chl1P70232 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Chl1P70232 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Chl1P70232 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chl1P70232 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Chl1P70232 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chl1P70232 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chl1P70232 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Chl1P70232 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Chl1P70232 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chl1P70232 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chl1P70232 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chl1P70232 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chl1P70232 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chl1P70232 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chl1P70232 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms