Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Hoxd13P70217 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Hoxd13P70217 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Hoxd13P70217 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Hoxd13P70217 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Hoxd13P70217 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Hoxd13P70217 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Hoxd13P70217 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Hoxd13P70217 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Hoxd13P70217 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxd13P70217 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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