Protein–RNA interactions for Protein: P63158

Hmgb1, High mobility group protein B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgb1P63158 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hmgb1P63158 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms