Protein–RNA interactions for Protein: P57748

Mmp20, Matrix metalloproteinase-20, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp20P57748 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp20P57748 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp20P57748 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp20P57748 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp20P57748 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp20P57748 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp20P57748 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp20P57748 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp20P57748 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp20P57748 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp20P57748 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp20P57748 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp20P57748 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp20P57748 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp20P57748 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp20P57748 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp20P57748 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp20P57748 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp20P57748 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp20P57748 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp20P57748 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp20P57748 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp20P57748 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp20P57748 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp20P57748 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp20P57748 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp20P57748 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp20P57748 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp20P57748 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp20P57748 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp20P57748 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp20P57748 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp20P57748 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp20P57748 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp20P57748 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp20P57748 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp20P57748 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp20P57748 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp20P57748 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp20P57748 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp20P57748 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp20P57748 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp20P57748 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp20P57748 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp20P57748 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp20P57748 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp20P57748 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp20P57748 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp20P57748 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp20P57748 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp20P57748 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp20P57748 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp20P57748 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp20P57748 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp20P57748 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp20P57748 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp20P57748 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp20P57748 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp20P57748 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp20P57748 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp20P57748 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp20P57748 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp20P57748 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp20P57748 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp20P57748 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp20P57748 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp20P57748 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp20P57748 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp20P57748 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp20P57748 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp20P57748 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp20P57748 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp20P57748 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp20P57748 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp20P57748 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp20P57748 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp20P57748 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp20P57748 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp20P57748 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp20P57748 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp20P57748 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp20P57748 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp20P57748 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp20P57748 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp20P57748 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp20P57748 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp20P57748 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp20P57748 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp20P57748 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp20P57748 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp20P57748 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp20P57748 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp20P57748 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp20P57748 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp20P57748 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp20P57748 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp20P57748 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp20P57748 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp20P57748 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp20P57748 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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