Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn18P56857 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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