Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
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