Protein–RNA interactions for Protein: P48772

Cox8b, Cytochrome c oxidase subunit 8B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox8bP48772 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cox8bP48772 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.1 ms