Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Mmp9P41245 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Mmp9P41245 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Mmp9P41245 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Mmp9P41245 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Mmp9P41245 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mmp9P41245 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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