Protein–RNA interactions for Protein: P38060

Hmgcl, Hydroxymethylglutaryl-CoA lyase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgclP38060 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HmgclP38060 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HmgclP38060 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HmgclP38060 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HmgclP38060 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HmgclP38060 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HmgclP38060 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HmgclP38060 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HmgclP38060 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HmgclP38060 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
HmgclP38060 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
HmgclP38060 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HmgclP38060 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HmgclP38060 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HmgclP38060 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HmgclP38060 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HmgclP38060 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HmgclP38060 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HmgclP38060 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HmgclP38060 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HmgclP38060 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HmgclP38060 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HmgclP38060 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HmgclP38060 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HmgclP38060 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HmgclP38060 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HmgclP38060 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HmgclP38060 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HmgclP38060 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HmgclP38060 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HmgclP38060 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HmgclP38060 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HmgclP38060 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HmgclP38060 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HmgclP38060 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HmgclP38060 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HmgclP38060 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HmgclP38060 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HmgclP38060 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HmgclP38060 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HmgclP38060 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HmgclP38060 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HmgclP38060 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HmgclP38060 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HmgclP38060 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HmgclP38060 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HmgclP38060 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HmgclP38060 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HmgclP38060 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HmgclP38060 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HmgclP38060 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HmgclP38060 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HmgclP38060 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HmgclP38060 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HmgclP38060 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HmgclP38060 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HmgclP38060 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HmgclP38060 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HmgclP38060 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HmgclP38060 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HmgclP38060 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HmgclP38060 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HmgclP38060 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HmgclP38060 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HmgclP38060 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HmgclP38060 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HmgclP38060 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HmgclP38060 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HmgclP38060 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HmgclP38060 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HmgclP38060 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HmgclP38060 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HmgclP38060 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HmgclP38060 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HmgclP38060 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HmgclP38060 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HmgclP38060 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HmgclP38060 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HmgclP38060 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HmgclP38060 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HmgclP38060 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HmgclP38060 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HmgclP38060 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HmgclP38060 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HmgclP38060 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HmgclP38060 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HmgclP38060 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HmgclP38060 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HmgclP38060 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HmgclP38060 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HmgclP38060 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HmgclP38060 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HmgclP38060 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HmgclP38060 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HmgclP38060 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HmgclP38060 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HmgclP38060 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HmgclP38060 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HmgclP38060 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HmgclP38060 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms