Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cd28P31041 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cd28P31041 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cd28P31041 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cd28P31041 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cd28P31041 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Cd28P31041 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cd28P31041 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cd28P31041 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cd28P31041 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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