Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxrgP28705 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxrgP28705 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrgP28705 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrgP28705 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrgP28705 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxrgP28705 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxrgP28705 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms