Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrbP28704 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RxrbP28704 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RxrbP28704 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RxrbP28704 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RxrbP28704 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RxrbP28704 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RxrbP28704 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RxrbP28704 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
RxrbP28704 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
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